wkhtmltopdfで画面が崩れる

サイトの表示を、pdfに保存するソフト「wkhtmltopdf」を試してみました。

バージョン　0.12.4

flexboxを使っている部分が崩れてしまい、正しく表示されません。

他に良いソフトはないでしょうか。
chromeで、pdfとして保存すれば、期待通りになりますが、これを自動的に行いたいと考えています。
chromeで、コマンドラインを使って、pdf保存できれば、解決するのですが。